首页专题 linux文件格式

linux文件格式

很多同学在进行编程学习时缺乏系统学习的资料。本页面基于linux文件格式内容，从基础理论到综合实战，通过实用的知识类文章，标准的编程教程，丰富的视频课程，为您在linux文件格式相关知识领域提供全面立体的资料补充。同时还包含 labelfor、label标签、lambda 的知识内容，欢迎查阅！

linux文件格式相关知识

文件格式——FASTA
FASTA文件的格式在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式）是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示，且允许在序列前添加序列名及注释。名字中最后一个字母A，是Alignment的意思,最初是由William. R. Pearson 和 David. J. Lipman在1988年所编写，目的是用于生物序列数据的处理,把FASTA作为这种存储有顺序的序列数据的文件后缀。FASTA文件以序列表示和序列作为一个基本单元，各行记录信息如下：第一行是由大于号">"开头的任意文字说明，用于序列标记，为了保证后续分析软件能够区分每条序列，单个序列的标识必须具有唯一性。；从第二行开始为序列本身，只允许使用既定的核苷酸或氨基酸编码符号。通常核苷酸符号大小写均可，而氨基酸常用大写字母。使用时应注意有些程序对大小写有明确要求。文件每行的字母一般不应超过80个字符。下面给出一个FASTA文件的例子，这是我们人类一个名为EGFR基因的部分序列。ENS
MP4文件格式入门
什么是MP4首先，介绍下封装格式。多媒体封装格式（也叫容器格式），是指按照一定的规则，将视频数据、音频数据等，放到一个文件中。常见的 MKV、AVI 以及本文介绍的 MP4 等，都是封装格式。MP4是最常见的封装格式之一，因为其跨平台的特性而得到广泛应用。MP4文件的后缀为.mp4，基本上主流的播放器、浏览器都支持MP4格式。MP4文件的格式主要由 MPEG-4 Part 12、MPEG-4 Part 14 两部分进行定义。其中，MPEG-4 Part 12 定义了ISO基础媒体文件格式，用来存储基于时间的媒体内容。MPEG-4 Part 14 实际定义了MP4文件格式，在MPEG-4 Part 12的基础上进行扩展。对从事直播、音视频相关工作的同学，很有必要了解MP4格式，下面简单介绍下。MP4文件格式概览MP4文件由多个box组成，每个box存储不同的信息，且box之间是树状结构，如下图所示。box类型有很多，下面是3个比较重要的顶层box：ftyp：File Type Box，描述文件遵从的MP4规范
基因组注释文件格式 --（一）BED文件格式
1、简介注释文件就是基因组的说明书。告诉我们哪些序列是编码蛋白的基因，哪些是非编码基因，外显子、内含子、UTR等的位置等等。注释文件在以下三个提供参考基因组的网站中都有提供，比如Ensemble、NCBI 、UCSC。但是现在最权威的人类和小鼠基因组的注释还属Gencode数据库。基因组注释（genomic features）通常使用Browser Extensible Data (BED) 或者 General Feature Format (GFF)文件格式表示，用UCSC Genome Browser进行可视化比较。Bed文件和GFF文件最基本的信息就是染色体或Contig的ID或编号，然后就是DNA的正负链信息，接着就是在染色体上的起始和终止位置数值。两种文件的区别在于，BED文件中起始坐标为0，结束坐标至少是1,； GFF中起始坐标是1而结束坐标至少是1。处理Bed格式和GFF格式的工具主要有 BedTools和Tophat 。2、文件格式介绍BED文件每行至少包括chrom，chromStart
linux挂载新硬盘并进行分区格式化
最近要给小伙伴们写几篇文章，关于《linux下误删除文件之后该如何恢复》。对于没有进程占用的文件想要进行数据恢复，不同的文件系统格式需要使用不同的工具，比如：ext4、xfs等。我找遍了我所有的虚拟机服务器，都没找到ext4文件格式的。因为ext4毕竟还是非常常用的文件系统格式，我写东西就希望能够系统一点，所以本文先介绍下：如何为linux操作系统挂载新硬盘，并将新硬盘格式化为ext4格式。一、新建硬盘或安装硬盘一个硬盘可以通过工具分成多个分区，但在linux运维中通常一个新硬盘就一个