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无法使用 Sympy 解决方案找到符号解决方案

无法使用 Sympy 解决方案找到符号解决方案

慕的地10843 2023-09-05 15:34:57
我正在研究描述分子荧光发射的动力学模型。我能够通过实验测量四个参数:两个寿命 (τ1, τ2)、荧光量子产率 (phi) 和辐射率 (kr)。我的模型包含三个未知的速率:kMR、kRM 和 knr。我有一组涉及所有这些值的三个方程,我想使用 sympy 求解三个未知数。这是代码:from sympy import *                                                                                                                                                                                                                                                                                                     kr, k1, k2, phi, kMR,kRM,knr = symbols('kr k1 k2 phi kMR kRM knr', real=True)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       #kr = 0.00014                                                                                                                                               #k1 = 1/9                                                                                                                                                   #k2 = 1/49                                                                                                                                                  #phi= 0.005                                                                                                                                                                如果我取消测量值的注释,几秒钟内就会找到数值解。然而,我的测量很容易出错,因此我有兴趣探索整个解决方案空间,以了解模型对每个参数的敏感程度。我还从不同的实验中得到了不同的测量值。因此,我想根据测量值获得 kMR、kRM 和 knr 的符号表达式。不幸的是,如果我运行它,它就不会收敛。你能帮我获得我正在寻找的象征性解决方案吗?谢谢你!
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1 回答

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千巷猫影

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我不确定到底solve在做什么,但我建议重写您的方程,而不需要您可以使用的平方根unrad。例如,您的第一个方程是:


In [50]: K1 - k1                                                                                                                               

Out[50]: 

                                _____________________________________________________________________

                               ╱                       2                                           2 

      kMR   kRM   knr   kr   ╲╱  4⋅kMR⋅kRM + (kMR + kr)  - (2⋅kMR + 2⋅kr)⋅(kRM + knr) + (kRM + knr)  

-k₁ + ─── + ─── + ─── + ── + ────────────────────────────────────────────────────────────────────────

       2     2     2    2                                       2                                    


In [51]: from sympy.solvers.solvers import unrad                                                                                               


In [52]: unrad(K1 - k1)                                                                                                                        

Out[52]: 

⎛  2                                                                   ⎞

⎝k₁  - k₁⋅kMR - k₁⋅kRM - k₁⋅knr - k₁⋅kr + kMR⋅knr + kRM⋅kr + knr⋅kr, []⎠

应用此给出一个多项式系统,其解可能是原始系统解的超集。


这给出:


In [53]: eq1 = unrad(K1-k1)[0]                                                                                                                 


In [54]: eq2 = unrad(K2-k2)[0]                                                                                                                 


In [55]: solve([eq1, eq2, Phi-phi], [kMR, kRM, knr])                                                                                           

Out[55]: 

⎡⎛  k₁⋅k₂⋅φ                   k₁⋅k₂⋅(k₁⋅φ - kr)⋅(k₂⋅φ - kr)            k₁⋅k₂⋅kr⋅(φ - 1)      ⎞⎤

⎢⎜- ─────── + k₁ + k₂ - kr, ──────────────────────────────────, ─────────────────────────────⎟⎥

⎢⎜     kr                      ⎛                            2⎞                              2⎟⎥

⎣⎝                          kr⋅⎝k₁⋅k₂⋅φ - k₁⋅kr - k₂⋅kr + kr ⎠  k₁⋅k₂⋅φ - k₁⋅kr - k₂⋅kr + kr ⎠⎦



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