我有一个获取 x 和 y 位置并执行最近邻搜索的函数。我想将此函数应用于两个数组,以便我可以获得数组中每个点的函数结果。我在这里给出了一些示例数据和我想应用的实际功能。我还调用了单点函数。我如何将此函数应用于出现在我的数组xs和中的匹配索引处的每个 x,y 对ys?import scipy.spatialimport scipyimport numpy as npimport pandas as pddef est_bathymetry(x,y,bathymetry_data,gsl_level=1278.3,n=4): grid_xy=np.array([x,y]).T def do_kdtree(grid_xy,points, n): #This function gets the kd tree for the sample, then returns the closest #points to each grid node as indices points=points[:2,:] points=list(points.transpose()) mytree = scipy.spatial.cKDTree(points) dist, indexes = mytree.query(grid_xy, k=n, n_jobs=-1) return dist, indexes dist, indexes = do_kdtree(grid_xy,bathymetry_data.iloc[:,0:2].values.T,n) avg_bath=np.nanmean(np.take(bathymetry_data['Bathymetry'], indexes)) return avg_bath #create sample datax=np.linspace(0,10,11,endpoint=True)xs=np.tile(x,(11,1))ys=xs.Tnp.random.seed(123)data=pd.DataFrame([np.random.uniform(0,10,100),np.random.uniform(0,10,100),np.random.normal(2000,100,100)]).Tdata.columns=['Lat','Long','Bathymetry']#example of function working on single inputavg_bathymetry=est_bathymetry(x=np.min(xs),y=np.min(ys),bathymetry_data=data)
1 回答
UYOU
TA贡献1878条经验 获得超4个赞
我发现使用 np.vectorize 我可以矢量化并应用该函数,这个函数实际上是适用的,但我需要删除其他输入。唯一的问题是运行完整数据集需要 225 天。将不得不回到绘图板。
添加回答
举报
0/150
提交
取消