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如何将numba与functools.reduce()一起使用

如何将numba与functools.reduce()一起使用

慕丝7291255 2022-08-25 15:16:07
我有以下代码,我试图使用并行循环,并且:numbafunctools.reduce()mulimport numpy as npfrom itertools import productfrom functools import reducefrom operator import mulfrom numba import jit, prangelst = [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]arr = np.array(lst)n = 3flat = np.ravel(arr).tolist()gen = np.array([list(a) for a in product(flat, repeat=n)])@jit(nopython=True, parallel=True)def mtp(gen):    results = np.empty(gen.shape[0])    for i in prange(gen.shape[0]):        results[i] = reduce(mul, gen[i], initializer=None)    return resultsmtp(gen)但这给了我一个错误:---------------------------------------------------------------------------TypingError                               Traceback (most recent call last)<ipython-input-503-cd6ef880fd4a> in <module>     10         results[i] = reduce(mul, gen[i], initializer=None)     11     return results---> 12 mtp(gen)~\Anaconda3\lib\site-packages\numba\dispatcher.py in _compile_for_args(self, *args, **kws)    399                 e.patch_message(msg)    400 --> 401             error_rewrite(e, 'typing')    402         except errors.UnsupportedError as e:    403             # Something unsupported is present in the user code, add help info~\Anaconda3\lib\site-packages\numba\dispatcher.py in error_rewrite(e, issue_type)    342                 raise e    343             else:--> 344                 reraise(type(e), e, None)    345     346         argtypes = []~\Anaconda3\lib\site-packages\numba\six.py in reraise(tp, value, tb)    666             value = tp()    667         if value.__traceback__ is not tb:--> 668             raise value.with_traceback(tb)    669         raise value    670 我不确定我哪里做错了。任何人都可以给我指出正确的方向吗?非常感谢。
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1 回答

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Cats萌萌

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您可以在 numba jitted 函数中使用 np.prod:


n = 3

lst = [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]

arr = np.array(lst)

flat = np.ravel(arr).tolist()

gen = [list(a) for a in product(flat, repeat=n)]


@jit(nopython=True, parallel=True)

def mtp(gen):

    results = np.empty(len(gen))

    for i in prange(len(gen)):

        results[i] = np.prod(gen[i])

    return results

或者,您可以使用如下所示的reduce(感谢@stuartarchibald指出这一点),尽管并行化在下面不起作用(至少从numba 0.48开始):


import numpy as np

from itertools import product

from functools import reduce

from operator import mul

from numba import njit, prange


lst = [[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]]

arr = np.array(lst)

n = 3

flat = np.ravel(arr).tolist()

gen = np.array([list(a) for a in product(flat, repeat=n)])


@njit

def mul_wrapper(x, y):

    return mul(x, y)


@njit

def mtp(gen):

    results = np.empty(gen.shape[0])

    for i in prange(gen.shape[0]):

        results[i] = reduce(mul_wrapper, gen[i], None)

    return results


print(mtp(gen))

或者,因为Numba内部有一点魔力,可以发现将转义函数并编译它们的闭包。(再次感谢@stuartarchibald),你可以这样,在下面:


@njit

def mtp(gen):

    results = np.empty(gen.shape[0])

    def op(x, y):

        return mul(x, y)

    for i in prange(gen.shape[0]):

        results[i] = reduce(op, gen[i], None)

    return results

但同样,并行在numba 0.48之前在这里不起作用。


请注意,核心开发团队成员推荐的方法是采用第一个使用 .它可以与并行标志一起使用,并具有更直接的实现。np.prod


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