奇点3.6.2安装

Question

我在 linux mint 中安装奇异 3.6.2 时遇到问题，我按照https://sylabs.io/guides/3.0/user-guide/installation.html的说明进行操作。我安装了依赖项和 Go。然后我运行命令安装最新版本：export VERSION=3.6.2 && # adjust this as necessary \mkdir -p $GOPATH/src/github.com/sylabs && \cd $GOPATH/src/github.com/sylabs && \wget https://github.com/sylabs/singularity/releases/download/v${VERSION}/singularity-${VERSION}.tar.gz && \tar -xzf singularity-${VERSION}.tar.gz && \cd ./singularity && \./mconfig错误是：    Configuring for project `singularity' with languages: C, Golang=> running pre-basechecks project specific checks ...=> running base system checks ... checking: host C compiler... cc checking: host C++ compiler... c++ checking: host Go compiler (at least version 1.13)... not found!mconfig: could not complete configuration我去（去版）go version go1.15.2 linux/amd64我不知道发生了什么！非常感谢！

Answer 1

我正在努力解决同样的错误。所有的建议都说你可能有一个旧版本的 Go，这就是原因。但事实证明，将 Go 和 Singularity 放在正确的位置更为重要。

我发现这些文档https://github.com/hpcng/singularity/blob/release-3.5/INSTALL.md是最有用和最正确的关于在哪里放置目录的内容。

关键是在 GOPATH 目录中克隆 Singularity：

默认情况下您不会拥有此目录，因此请先创建它

$ mkdir -p ${GOPATH}/src/github.com/sylabs && \

  cd ${GOPATH}/src/github.com/sylabs && \

  git clone https://github.com/sylabs/singularity.git && \

  cd singularity

确保你的奇点在这里：{GOPATH}/src/github.com/sylabs/singularity

总结一下：

Go 本身位于此处/usr/local/go

GOPATH 类似于home/your_username/go，奇点将位于内部，例如home/your_username/go/src/github.com/sylabs/singularity

Answer 2

如果有人遇到此问题，请遵循此安装指南。

sudo apt-get update && \

sudo apt-get install -y build-essential \

libseccomp-dev pkg-config squashfs-tools cryptsetup

sudo rm -r /usr/local/go

export VERSION=1.13.15 OS=linux ARCH=amd64  # change this as you need

wget -O /tmp/go${VERSION}.${OS}-${ARCH}.tar.gz https://dl.google.com/go/go${VERSION}.${OS}-${ARCH}.tar.gz && \

sudo tar -C /usr/local -xzf /tmp/go${VERSION}.${OS}-${ARCH}.tar.gz

echo 'export GOPATH=${HOME}/go' >> ~/.bashrc && \

echo 'export PATH=/usr/local/go/bin:${PATH}:${GOPATH}/bin' >> ~/.bashrc && \

source ~/.bashrc

curl -sfL https://install.goreleaser.com/github.com/golangci/golangci-lint.sh |

sh -s -- -b $(go env GOPATH)/bin v1.21.0

mkdir -p ${GOPATH}/src/github.com/sylabs && \

cd ${GOPATH}/src/github.com/sylabs && \

git clone https://github.com/sylabs/singularity.git && \

cd singularity

git checkout v3.6.3

cd ${GOPATH}/src/github.com/sylabs/singularity && \

./mconfig && \

cd ./builddir && \

make && \

sudo make install

singularity version

Answer 3

该问题已在5099中报告。

#5320还提到：

我删除了 PPO python 3.6，效果很好！

确保没有以 root 身份执行，它的 $PATH 与您当前的用户不同。