在 Ubuntu 实例上安装 mpi4py 时出错

Question

我正在尝试在我的 Ubuntu 18.04 实例上安装 mpi4py。我已经安装了 python3.6.5。首先，我尝试sudo apt-get build-dep python-mpi4py并得到：正在阅读包列表...完成 E：您必须在 sources.list 中放入一些“源”URI然后我尝试简单地安装pip install mpi4py. 我收到一条很长的错误消息，其中包含以下一些最重要的部分：checking for library 'lmpe' ...  /home/ubuntu/anaconda3/envs/tensorflow_p36/bin/mpicc -pthread -B /home/ubuntu/anaconda3/envs/tensorflow_p36/compiler_compat -Wl,--sysroot=/ -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -c _configtest.c -o _configtest.o  --------------------------------------------------------------------------  The Open MPI wrapper compiler was unable to find the specified compiler  x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc in your PATH.  Note that this compiler was either specified at configure time or in  one of several possible environment variables.  --------------------------------------------------------------------------  failure.大多数库都会发生此故障。我只包括其中之一，并且  warning: build_clib: command '/home/ubuntu/anaconda3/envs/tensorflow_p36/bin/mpicc' failed with exit status 1  warning: build_clib: building optional library "vt-mpi" failed  checking for library 'vt-hyb' ...  /home/ubuntu/anaconda3/envs/tensorflow_p36/bin/mpicc -pthread -B /home/ubuntu/anaconda3/envs/tensorflow_p36/compiler_compat -Wl,--sysroot=/ -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -c _configtest.c -o _configtest.o  --------------------------------------------------------------------------  The Open MPI wrapper compiler was unable to find the specified compiler  x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc in your PATH.  Note that this compiler was either specified at configure time or in  one of several possible environment variables.运行which mpcc给出：(tensorflow_p36) ubuntu@ip-172-31-35-200:~$ which mpicc/home/ubuntu/anaconda3/envs/tensorflow_p36/bin/mpicc如何将指定的编译器 x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc 添加到我的 PATH 以解决此错误？

Answer 1

只需运行：

conda install -c anaconda mpi4py如此处所示。

此外，Lidandro Dalcin 的有用评论：

我猜你缺少 mpich-mpicc 包，这是一个依赖于正确编译器的元包。为什么要使用 pip 安装 mpi4py？也许您需要的只是 conda install mpi4py （可在 conda-forge 频道中获得）？