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使用 zipfile 和 scipy.io.arff 从 ZIP 读取 ARFF

使用 zipfile 和 scipy.io.arff 从 ZIP 读取 ARFF

森栏 2021-12-09 14:48:51
我想在 scikit-learn 中处理相当大的 ARFF 文件。这些文件位于 zip 存档中,我不想在处理之前将存档解压缩到文件夹中。因此,我使用 Python 3.6 的 zipfile 模块:from zipfile import ZipFilefrom scipy.io.arff import loadarffarchive = ZipFile( 'archive.zip', 'r' )datafile = archive.open( 'datafile.arff' )data = loadarff( datafile )# …datafile.close()archive.close()但是,这会产生以下错误:Traceback (most recent call last):  File "./m.py", line 6, in <module>    data = loadarff( datafile )  File "/usr/lib64/python3.6/site-packages/scipy/io/arff/arffread.py", line 541, in loadarff    return _loadarff(ofile)  File "/usr/lib64/python3.6/site-packages/scipy/io/arff/arffread.py", line 550, in _loadarff    rel, attr = read_header(ofile)  File "/usr/lib64/python3.6/site-packages/scipy/io/arff/arffread.py", line 323, in read_header    while r_comment.match(i):TypeError: cannot use a string pattern on a bytes-like object根据loadarff 文档,loadarff需要一个类似文件的对象。根据zipfile 文档,open返回一个类似文件的ZipExtFile.因此,我的问题是如何使用什么ZipFile.open作为 ARFF 输入返回到loadarff.注意:如果我手动解压缩并直接使用 加载 ARFF data = loadarff( 'datafile.arff' ),一切都很好。
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1 回答

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慕仙森

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from io import BytesIO, TextIOWrapper

from zipfile import ZipFile

from scipy.io.arff import loadarff


zfile = ZipFile('archive.zip', 'r')

in_mem_fo = TextIOWrapper(BytesIO(zfile.read('datafile.arff')), encoding='utf-8')

data = loadarff(in_mem_fo)

读zfile入内存BytesIO对象。TextIOWrapper与 一起使用encoding='utf-8'。在loadarff.


编辑:结果zfile.open()返回一个类似文件的对象,因此可以通过以下方式完成上述操作:


zfile = ZipFile('archive.zip', 'r')

in_mem_fo = TextIOWrapper(zfile.open('datafile.arff'), encoding='ascii')

data = loadarff(in_mem_fo)


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