我正在处理格式为 nii.gz 的图像。因此,我使用nibabel来打开它们。问题是当我打开图像,将它们转换为 numpy 数组并将它们转换回 Nifti 格式时,输出大小发生了变化。顺序是:nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')np_img = ct_images.get_fdata()nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to niftinib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')初始文件为~45 MB,运行上述代码后,图像为~65 MB. 我知道原始图像是 16 位编码的。我最初的理论是,当转换为 numpy 数组时,它们被编码为64-bit确实如此。所以我尝试了以下方法:nifti_image = nib.load('/my_path_to_image/image.nii.gz')np_img = ct_images.get_fdata()np_img = np_img.astype(numpy.float16, copy=False)nifti_final = nib.Nifti1Image(data, affine=np.eye(4)) # Convert them to niftinib.save(nifti_final , 'image.nii.gz')但是,输出仍然是相同的大小~65MB。任何想法为什么会发生这种情况?
1 回答
喵喔喔
TA贡献1735条经验 获得超5个赞
您应该将原始 nifti 仿射和标题信息添加到输出 nifti。例如,在您的情况下:
nifti_final = nib.Nifti1Image(data, nifti_image.affine, nifti_image.header)
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