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TA贡献1886条经验 获得超2个赞
还有另一种使用 OpenCV 和 pydicom 库将 Dicom 图像转换为 JPEG 或 PNG 格式的有效方法。下面的代码在一次运行中将所有 dicom 图像集转换为 jpeg/png(使用 for 循环)。
import pydicom as dicom
import os
import cv2
# make it True if you want in PNG format
PNG = False
# Specify the .dcm folder path
folder_path = "/Image"
# Specify the output .jpg/png folder path
jpg_folder_path = "/JPGImage"
images_path = os.listdir(folder_path)
for n, image in enumerate(sorted(images_path)):
print(os.path.join(folder_path, image))
ds = dicom.dcmread(os.path.join(folder_path, image), force=True)
ds.file_meta.TransferSyntaxUID = dicom.uid.ImplicitVRLittleEndian
pixel_array_numpy = ds.pixel_array
if PNG == False:
image = image.replace('.dcm', '.jpg')
else:
image = image.replace('.dcm', '.png')
pixel_array_numpy2 = cv2.flip(pixel_array_numpy, 0)
cv2.imwrite(os.path.join(jpg_folder_path, image), pixel_array_numpy2)

TA贡献1780条经验 获得超1个赞
丢失信息的问题取决于像素深度,而不是图像压缩。您的 DICOM 图像可能每像素大约 11 位(从 -1024 到 1023),甚至可能更多。您无需设置强度窗口即可将其转换为 8 位图像。
这意味着值 -1024 的原始像素变为黑色,+1023 的像素变为白色,但图像最重要的部分,从 -100 到 +300 左右变为平均灰色。如果你对肺感兴趣,那么重要的值就低,如果你想看到骨头,那么它们就更高等等。最重要的是,你不能在单个 png/jpg/bmp 图像上看到 DICOM 图像的所有部分。您需要一个特殊的查看器,它允许设置灰度级。可以处理全像素深度的最常见的非医学格式是 TIFF,但您仍然需要一个特殊的查看器。
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