附加表（不同的行号）以在python中可视化

Question

我正在努力将以下表格简单地附加到一个表格中：chr    pos    gene1    100    A2    150    Bchr    pos    gene1    100    A2    150    F4    800    D我希望决赛桌看起来像：chr    pos    gene    chr    pos    gene1    100    A    1    100    A2    150    B    2    150    F                4    800    D这些表具有相同的列数，但具有不同的行数。如果需要，可以使用NaN或0填充这些空白点。这只是为了更好地一次直观地比较几个表文件。不需要花哨的东西。我尝试从以下方法中使用熊猫：https：//pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/merging.html，但是这里的方法将具有相同索引的行组合在一起-我不需要。我还尝试仅使用csv.reader（两个如何使用python水平合并几个.csv文件？），但是我的输出为空，没有错误消息...不确定是否是因为行数不同。

Answer 1

尽管它使该数据框很难用于以后的处理，但是您可以使用进行此操作pd.concat。如果分别调用df1和的数据帧df2：

>>> pd.concat((df1,df2), axis=1).replace(np.nan, '')

   chr  pos gene  chr  pos gene

0    1  100    A    1  100    A

1    2  150    B    2  150    F

2                   4  800    D

该replace电话是刚刚拿到空白字符串代替NaN。正如您在问题中所说，NaNs是可以接受的，因此您可以忽略它，而只需使用：

>>> pd.concat((df1,df2), axis=1)

   chr    pos gene  chr  pos gene

0  1.0  100.0    A    1  100    A

1  2.0  150.0    B    2  150    F

2  NaN    NaN  NaN    4  800    D