Rpy2：如何将字典列表转换为R数据框

Question

我有以下字典的Python列表（来自sqlite3行工厂）：obs = [{'ave': 0.027, 'pap': 0.277}, {'ave': 0.29, 'pap': 0.333}, {'ave': 0.25, 'pap': 0.5}]我想将其转换为R data.frame，以便与rpy2（版本2.3.6）一起使用，因此它看起来像这样    ave   pap  1 0.027 0.277 2 0.29  0.3333 0.25  0.5我能够将单个“行”转换为data.frame，如下所示：robjects.DataFrame(obs[0])    ave   pap 1 0.027 0.277 使用robjects.DataFrame(obs)不起作用... ValueError：obj可以是可迭代类的实例（例如Python dict，rpy2.rlike.container OrdDict或VECSXP类型的rpy2.rinterface.SexpVector的实例。我也尝试使用将其转换为OrdDict，rpy2.rlike.container.OrdDict(obs)但出现ValueError：太多值无法解压我认为有许多不同的技术可以实现这一目标，而rpy2和Python中的大量数据结构使我感到困惑。

Answer 1

当obs变大时，创建R数据帧并将其附加会导致性能问题。解决此问题的一种方法是在Python中“转置”结果。

# "transpose" the data structure in Python

from collections import defaultdict

d = defaultdict(list)

for row in obs:

    for colname in row:

        d[colname].append(row[colname])

# Assuming that all data are floats

# (if not the case a mapping between SQLite3 types and R vector types is needed)

for rpy2.robjects.vectors import FloatVector

for colname in d:

    d[colname] = FloatVector(d[colname])

# data frame

from rpy2.robjects import DataFrame

dataf = DataFrame(d)

Answer 2

我实际上找到了一个答案（这可能不是最有效的，但对我来说是有用的）：

在Python中：

df = robjects.DataFrame(obs[0])

for ob in obs[1:]:

    df = df.rbind(robjects.DataFrame(ob))

如果有人有更好，更优雅，更有效的解决方案，欢迎他/她发布。