使用gc（）命令强制垃圾收集在R中运行

Question

我定期草率地编程。好的，我一直都在草率地编写程序，但有时会以内存不足错误的形式赶上我。我开始练习一些纪律，用rm()命令删除对象，情况会变得更好。我在网上看到有关gc()在删除大数据对象后是否应显式调用的混合消息。有人说R返回内存错误之前它将运行，gc()而另一些人则说手动强制gc是一个好主意。gc()为了确保最大的内存可用性，是否应该在删除大对象之后运行？

Answer 1

“大概。” 我也这样做，甚至经常像

cleanMem <- function(n=10) { for (i in 1:n) gc() }

但是，以我的经验，这并不能使记忆恢复到原始状态。

因此，我通常要做的是将任务保留在脚本文件中，并使用“ r”前端（在Unix上和从“ littler”软件包中）执行那些任务。Rscript是该其他OS上的替代方案。

该工作流程恰好与

统计分析和报告编写工作流

在会话中管理可用内存的技巧

我们之前在这里介绍过。

Answer 2

晚会晚了一点，但是：

显式调用gc将“现在”释放一些内存。...因此，如果其他进程需要内存，则可能是个好主意。例如在致电system或类似电话之前。或者，当您“完成”脚本后，R会闲置一会儿，直到下一个作业到达为止-再次如此，以便其他进程获得更多的内存。

如果您只是想让脚本运行得更快，那没关系，因为R会在需要时稍后调用它。由于正常的GC周期可能永远都不需要调用它，因此它甚至可能更慢。

...但是，例如，如果您想测量时间，通常最好在运行测试之前进行GC。这是system.time默认情况下的功能。

更新正如@DWin指出的那样，R（或C＃或Java等）并不总是知道何时内存不足以及GC是否需要运行。因此，有时您可能需要执行GC来解决内存系统中的缺陷。