sklearn错误ValueError：输入包含NaN，无穷大或对于dtype（'float64'）

Question

我正在使用sklearn，并且亲和力传播存在问题。我建立了一个输入矩阵，但不断收到以下错误。ValueError: Input contains NaN, infinity or a value too large for dtype('float64').我跑了np.isnan(mat.any()) #and gets Falsenp.isfinite(mat.all()) #and gets True我尝试使用mat[np.isfinite(mat) == True] = 0删除无限值，但这也不起作用。我该怎么做才能摆脱矩阵中的无限值，以便可以使用亲和力传播算法？我正在使用anaconda和python 2.7.9。

Answer 1

这可能会在scikit内部发生，并且取决于您在做什么。我建议您阅读所用功能的文档。您可能正在使用一种方法，例如，这取决于您的矩阵是正定的且不满足该条件。

编辑：我怎么能错过呢：

np.isnan(mat.any()) #and gets False

np.isfinite(mat.all()) #and gets True

显然是错误的。正确的是：

np.any(np.isnan(mat))

和

np.all(np.isfinite(mat))

您想检查任何元素是否为NaN，而不是any函数的返回值是否为数字...

Answer 2

将sklearn与pandas一起使用时，出现相同的错误消息。我的解决方案是df在运行任何sklearn代码之前重置数据帧的索引：

df = df.reset_index()

当我删除自己的某些条目时，我多次遇到此问题df，例如

df = df[df.label=='desired_one']