请问dcast错误：“聚合函数缺失：默认为长度”

Question

dcast错误：“聚合函数缺失：默认为长度”我的df看起来是这样的：Id  Task Type    Freq  3     1    A       23     1    B       33     2    A       33     2    B       04     1    A       34     1    B       34     2    A       14     2    B       3我想通过ID重组并得到：Id   A    B …  Z    3    5    3      4    4    6        我试过：df_wide <- dcast(df, Id + Task ~ Type, value.var="Freq")得到了错误：聚合函数缺失：默认为长度我不知道该放什么进去fun.aggregate..有什么问题吗？

Answer 1

您收到此警告的原因是在fun.aggregate(见?dcast):

如果变量没有标识每个输出单元格的单个观察，则需要聚合函数。默认为长度(带有消息)(如果需要但未指定)

因此，当宽数据帧中的一个点有多个值时，就需要一个聚合函数。

基于您的数据的解释：

当你使用dcast(df, Id + Task ~ Type, value.var="Freq")你得到：

  Id Task A B1  3    1 2 32  3    2 3 03  4    1 3 34  4    2 1 3

这是合乎逻辑的，因为对于每一个组合Id, Task和Type只有价值Freq..但是当你用dcast(df, Id ~ Type, value.var="Freq")您可以得到这个(包括一条警告消息)：

Aggregation function missing: defaulting to length
  Id A B1  3 2 22  4 2 2

现在，回顾一下您的数据的顶部：

Id  Task Type    Freq  
3     1    A       23     1    B       33     2    A       33     2    B       0

你知道为什么会这样。的每一个组合Id和Type中有两个值Freq(ID 3：2和3为A & 3和0用于类型B)，虽然您只能在这个位置上放置一个值，但对于每个值，则只能将一个值放置在宽数据中。type..因此dcast希望将这些值聚合为一个值。默认的聚合函数是length，但是您可以使用其他聚合函数，如sum, mean, sd或自定义函数，方法是将它们指定为fun.aggregate.

例如，用fun.aggregate = sum你得到：

  Id A B1  3 5 32  4 4 6

现在没有警告，因为dcast被告知在有多个值时该做什么：返回值的和。

Answer 2

例如，对于您使用的字符)使用toString-发挥汇总作用：dcast(df, Id ~ Type, value.var="Freq", fun.aggregate = toString)..或者，您也可以定义自己的聚合函数-例如：f.agg <- function(x) paste(x, collapse = "-")-并使用：dcast(df, Id ~ Type, value.var="Freq", fun.aggregate = f.agg)