从命令行运行R脚本

Question

从命令行运行R脚本我有一个文件，名为a.r，它有一个chmod755，sayHello <- function(){    print('hello')}sayHello()我如何通过命令行运行它？

Answer 1

如果要将输出打印到终端，最好使用Rscript

Rscript a.R

请注意，在使用R CMD BATCH a.R该输出而不是将输出重定向到标准输出并在终端上显示时，将创建一个名为a.Rout的新文件。

R CMD BATCH a.R# Check the outputcat a.Rout

关于使用Rscript的另一个注意事项是它methods默认不加载包，这可能会导致混淆。因此，如果您依赖于方法提供的任何内容，您将需要在脚本中明确加载它。

如果您真的想使用./a.R调用脚本的方式，可以#!在脚本顶部添加一个适当的

#!/usr/bin/env RscriptsayHello <- function(){
   print('hello')}sayHello()

我还要注意，如果你在* unix系统上运行，那么有一个有用的小型软件包可以为R提供简单的命令行管道。

Answer 2

这不直接回答这个问题。但有人可能会在这里结束，因为他们想从终端运行R的oneliner。例如，如果您只想安装一些丢失的软件包并退出，这个oneliner可以非常方便。当我突然发现我错过了一些软件包时，我经常使用它，我想将它们安装到我想要的地方。

R -e 'install.packages(c("package1", "package2"))' # install to default location. sudo R -e 'install.packages(c("package1", "package2"), lib="/usr/local/lib/R/site-library")' # install to location that requires root.

Answer 3

命令行运行R脚本的另一种方法是：

R < scriptName.R --no-save

或者--save。