你如何专门订购ggplot2 x轴而不是字母顺序？

Question

你如何专门订购ggplot2 x轴而不是字母顺序？我想一个使heatmap使用ggplot2使用geom_tiles此功能，下面是我的代码：p<-ggplot(data,aes(Treatment,organisms))+geom_tile(aes(fill=S))+   scale_fill_gradient(low = "black",high = "red") +    scale_x_discrete(expand = c(0, 0)) +    scale_y_discrete(expand = c(0, 0)) +    theme(legend.position = "right",      axis.ticks = element_blank(),      axis.text.x = element_text(size = base_size, angle = 90, hjust = 0, colour = "black"),     axis.text.y = element_text(size = base_size, hjust = 1, colour = "black")).数据是我的data.csv文件我的X轴是治疗的类型我的Y轴是有机体的类型我对命令和编程不太熟悉，而且我对此比较陌生。我只是想能够指定x轴上标签的顺序。在这种情况下，我试图指定“治疗”的顺序。默认情况下，它按字母顺序排序。如何覆盖此数据/保持数据的顺序与原始csv文件中的顺序相同？我试过这个命令scale_x_discrete(limits=c("Y","X","Z"))其中x，y和z是我的治疗条件顺序。然而，它不能很好地工作，并给我缺少热箱。

Answer 1

如果没有完整，可重复的示例，有点难以回答您的具体问题。但是这样的事情应该有效：

#Turn your 'treatment' column into a character vectordata$Treatment <- as.character(data$Treatment)#Then turn it back into a factor with the levels in the correct orderdata$Treatment <- factor(data$Treatment, levels=unique(data$Treatment))

在此示例中，因子的顺序将与data.csv文件中的顺序相同。

如果您喜欢不同的订单，可以手动订购：

data$Treatment <- factor(data$Treatment, levels=c("Y", "X", "Z"))

但是，如果你有很多级别，这是危险的：如果你弄错了任何一个，那将导致问题。

Answer 2

最常见的答案提供了一种需要更改基础数据框架的解决方案。这不是必需的。也可以直接在aes()调用中进行分解，或者为此创建一个向量。

这肯定与@Drew Steen的答案没什么不同，但是与不改变原始数据框架的重要区别。

level_order <- c('virginica', 'versicolor', 'setosa') #this vector might be useful for other plots/analysesggplot(iris, aes(x = factor(Species, level = level_order), y = Petal.Width)) + geom_col()

要么

level_order <- factor(iris$Species, level = c('virginica', 'versicolor', 'setosa'))ggplot(iris, aes(x = level_order, y = Petal.Width)) + geom_col()

或
直接在aes()没有预先创建的矢量的呼叫中：

ggplot(iris, aes(x = factor(Species, level = c('virginica', 'versicolor', 'setosa')), y = Petal.Width)) + geom_col()