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准确地理解data.table何时是对另一个data.table的引用

准确地理解data.table何时是对另一个data.table的引用

潇潇雨雨 2019-06-05 11:15:00
我很难理解data.table..有些操作似乎“打破”了引用,我想确切地了解发生了什么。关于创建data.table从另一个data.table(经<-,然后通过以下方法更新表:=,原来的表也被修改了。这是预期的,如下所示:?data.table::copy和StackOverflow:pass-by-reference-the-operator-in-the-data-table-package下面是一个例子:library(data.table)DT <- data.table(a=c(1,2), b=c(11,12))print(DT)#      a  b# [1,] 1 11# [2,] 2 12newDT <- DT         # reference, not copynewDT[1, a := 100] # modify new DTprint(DT)           # DT is modified too.#        a  b# [1,] 100 11# [2,]   2 12但是,如果我插入一个非-:=之间的基础修改<-任务和:=上面的线,DT现在不再修改:DT = data.table(a=c(1,2), b=c(11,12))newDT <- DT         newDT$b[2] <- 200  # new operationnewDT[1, a := 100]print(DT)#      a  b# [1,] 1 11# [2,] 2 12所以看起来newDT$b[2] <- 200行在某种程度上破坏了引用。我猜想这会以某种方式调用一个副本,但我想完全了解R是如何处理这些操作的,以确保我不会在代码中引入潜在的bug。如果有人能向我解释这件事,我会非常感激的。
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2 回答

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肥皂起泡泡

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是的,它是在R中使用的<-(或=或->)的副本。整体对象。您可以使用tracemem(DT)和.Internal(inspect(DT)),如下所示。这个data.table特征:=和set()通过引用将它们传递给任何对象。因此,如果该对象以前被复制(通过subas签名)<-或显式copy(DT))然后是通过引用修改的副本。


DT <- data.table(a = c(1, 2), b = c(11, 12)) 

newDT <- DT 


.Internal(inspect(DT))

# @0000000003B7E2A0 19 VECSXP g0c7 [OBJ,NAM(2),ATT] (len=2, tl=100)

#   @00000000040C2288 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 1,2

#   @00000000040C2250 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 11,12

# ATTRIB:  # ..snip..


.Internal(inspect(newDT))   # precisely the same object at this point

# @0000000003B7E2A0 19 VECSXP g0c7 [OBJ,NAM(2),ATT] (len=2, tl=100)

#   @00000000040C2288 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 1,2

#   @00000000040C2250 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 11,12

# ATTRIB:  # ..snip..


tracemem(newDT)

# [1] "<0x0000000003b7e2a0"


newDT$b[2] <- 200

# tracemem[0000000003B7E2A0 -> 00000000040ED948]: 

# tracemem[00000000040ED948 -> 00000000040ED830]: .Call copy $<-.data.table $<- 


.Internal(inspect(DT))

# @0000000003B7E2A0 19 VECSXP g0c7 [OBJ,NAM(2),TR,ATT] (len=2, tl=100)

#   @00000000040C2288 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 1,2

#   @00000000040C2250 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 11,12

# ATTRIB:  # ..snip..


.Internal(inspect(newDT))

# @0000000003D97A58 19 VECSXP g0c7 [OBJ,NAM(2),ATT] (len=2, tl=100)

#   @00000000040ED7F8 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 1,2

#   @00000000040ED8D8 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 11,200

# ATTRIB:  # ..snip..

注意,即使是a向量被复制(不同的十六进制值表示向量的新副本),尽管a没有改变。甚至整个b被复制,而不仅仅是更改需要更改的元素。对于大型数据来说,这是很重要的避免,以及为什么:=和set()被介绍给data.table.


现在,用我们的拷贝newDT我们可以参考修改:


newDT

#      a   b

# [1,] 1  11

# [2,] 2 200


newDT[2, b := 400]

#      a   b        # See FAQ 2.21 for why this prints newDT

# [1,] 1  11

# [2,] 2 400


.Internal(inspect(newDT))

# @0000000003D97A58 19 VECSXP g0c7 [OBJ,NAM(2),ATT] (len=2, tl=100)

#   @00000000040ED7F8 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 1,2

#   @00000000040ED8D8 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 11,400

# ATTRIB:  # ..snip ..

注意,所有3个十六进制值(列点的向量,以及2列中的每一列)都保持不变。因此,它确实是通过引用而修改的,根本没有副本。


或者,我们可以修改原始DT引用:


DT[2, b := 600]

#      a   b

# [1,] 1  11

# [2,] 2 600


.Internal(inspect(DT))

# @0000000003B7E2A0 19 VECSXP g0c7 [OBJ,NAM(2),ATT] (len=2, tl=100)

#   @00000000040C2288 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 1,2

#   @00000000040C2250 14 REALSXP g0c2 [NAM(2)] (len=2, tl=0) 11,600

#   ATTRIB:  # ..snip..

这些十六进制值与我们看到的原始值相同。DT上面。类型example(copy)有关更多示例,请使用tracemem以及与.的比较data.frame.


顺便说一下,如果你tracemem(DT)然后DT[2,b:=600]你会看到一份报告。的前10行的副本。print方法可以。用invisible()或在函数或脚本中调用时,print方法不被调用。


所有这一切也适用于内部功能;即,:=和set()不要在写时复制,即使在函数中也是如此。如果需要修改本地副本,请调用x=copy(x)在函数开始的时候。但是,记住data.table适用于大数据(以及小数据的快速编程优势)。我们故意不想复制大对象(永远)。因此,我们不需要考虑通常的3*工作记忆因素的经验法则。我们试着只需要一个列那么大的工作记忆(即工作记忆系数为1/nol,而不是3)。


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反对 回复 2019-06-05
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繁花如伊

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简单总结一下。

<-带着data.table就像基本;也就是说,在完成以下操作之前,将不进行复制。<-(例如更改列名或更改元素,如DT[i,j]<-v)。然后,它获取整个对象的副本,就像基一样。这就是所谓的抄写。我想,应该更好地称为“仿冒”!当您使用“特殊”时,它不会复制。:=运算符,或set*data.table..如果您有大量数据,您可能希望使用它们。:=set*不会复制data.table甚至在职能范围内。

给定此示例数据:

DT <- data.table(a=c(1,2), b=c(11,12))

以下只是“绑定”另一个名称DT2绑定到当前绑定到名称的相同数据对象。DT :

DT2 <- DT

这永远不会复制,也不会在基础上复制。它只是标记数据对象,以便R知道两个不同的名称(DT2DT)指向同一个对象。所以R需要复制对象,如果两者都是副签名以后的事。

那是完美的data.table也是。这个:=不是为了这么做。因此,下面是一个故意的错误,因为:=不只是用于绑定对象名称:

DT2 := DT    # not what := is for, not defined, gives a nice error

:=是为了次签署参考一下。但你不像你在基地里那样使用它:

DT[3,"foo"] := newvalue    # not like this

你就这样用它:

DT[3,foo:=newvalue]    # like this

改变了DT参考一下。假设您添加了一个新列new通过引用数据对象,没有必要这样做:

DT <- DT[,new:=1L]

因为RHS已经改变了DT参考一下。额外的DT <-就是误解了什么:=的确如此。你可以把它写在那里,但它是多余的。

DT因引用而更改:=,即使在职能范围内:

f <- function(X){
    X[,new2:=2L]
    return("something else")}f(DT)   # will change DTDT2 <- DT
f(DT)   # will change both DT and DT2 (they're the same data object)

data.table是用于大型数据集的,请记住。如果你有20 GBdata.table在记忆中,你需要一个方法来做到这一点。这是一个非常慎重的设计决策data.table.

当然可以复制。您只需要告诉data.table,您肯定要复制您的20 GB数据集,方法是使用copy()职能:

DT3 <- copy(DT)   # rather than DT3 <- DTDT3[,new3:=3L]     # now, this just changes DT3 because it's a copy, not DT too.

为了避免复制,不要使用基类型分配或更新:

DT$new4 <- 1L                 # will make a copy so use :=attr(DT,"sorted") <- "a"      # will make a copy use setattr()

如果您希望确保您正在通过引用进行更新,请使用.Internal(inspect(x))然后看看成分的内存地址值(见MatthewDowle的答案)。

写字:=在……里面j这样你就可以参考按组..可以按组按引用添加新列。所以这就是为什么:=在里面是这样做的[...] :

DT[, newcol:=mean(x), by=group]


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反对 回复 2019-06-05
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