根据W3C提供的规则，只限制同一页面中的ID不可重复，但并不限制不同页面之间，包括框架包含的，因为框架其实也是两个不同页面，只不过展现在了一起。至于JS调用，JS只能调用到当前页面的DOM元素，如果你要调用另一个页面的元素只能跨框架操作，所以不会冲突。
根据你描述的情况，1.html和2.html是完全独立开的，JS是分别在两个页面中执行，并不冲突。框架放在一起同时打开并不会有任何影响

另外，理论上同一页面ID不可重复，当然你真这么做了也不会有事，浏览器允许容错。当然最好不要这样做啦，会给你带来许多不必要的麻烦。