这个问题可能就涉及到版本冲突了，如你所说如果c3引用了c2中的css文件，master后期修改了css文件，那么c2将变成一个新的版本（就叫c4吧），之后在merge的时候，c3中的修改会被合并到master(也就是c4上)，此时有两种情况

1.c3没有修改css文件或者修改的地方和c4中修改的地方不冲突，那么他们就合并成一个新版本了，c4的修改和c3的修改都同时存在，他们都被合并到新版本里了；

2c3修改了css，c4也修改了css，而且修改的地方重复了，也就是发生冲突了，那么就得在合并的时候解决冲突然后再合并了。

总的来说，只要多个分支（包括master）都同时进行修改，就没有办法防止冲突，只能在冲突发生的时候根据需要解决。