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在Linux中使用matplotlib进行科学画图

标签:
Python Linux

如果你想要在Linxu中获得一个高效、自动化、高质量的科学画图的解决方案,应该考虑尝试下matplotlib库。Matplotlib是基于python的开源科学测绘包,基于python软件基金会许可证发布。大量的文档和例子、集成了Python和Numpy科学计算包、以及自动化能力,是作为Linux环境中进行科学画图的可靠选择的几个原因。这个教程将提供几个用matplotlib画图的例子。


特性

支持众多的图表类型,如:bar,box,contour,histogram,scatter,line plots....

基于python的语法

集成Numpy科学计算包

数据源可以是 python 的列表、键值对和数组

可定制的图表格式(坐标轴缩放、标签位置及标签内容等)

可定制文本(字体,大小,位置...)

支持TeX格式(等式,符号,希腊字体...)

与IPython相兼容(允许在 python shell 中与图表交互)

自动化(使用 Python 循环创建图表)

用Python 的循环迭代生成图片

保存所绘图片格式为图片文件,如:png,pdf,ps,eps,svg等

基于Python语法的matplotlib是其许多特性和高效工作流的基础。世面上有许多用于绘制高质量图的科学绘图包,但是这些包允许你直接在你的Python代码中去使用吗?除此以外,这些包允许你创建可以保存为图片文件的图片吗?Matplotlib允许你完成所有的这些任务。从而你可以节省时间,使用它你能够花更少的时间创建更多的图片。


安装

安装Python和Numpy包是使用Matplotlib的前提,安装Numpy的指引请见该链接。


可以通过如下命令在Debian或Ubuntu中安装Matplotlib:


$ sudo apt-get install python-matplotlib 

在Fedora或CentOS/RHEL环境则可用如下命令:


$ sudo yum install python-matplotlib 

Matplotlib 例子

本教程会提供几个绘图例子演示如何使用matplotlib:


离散图和线性图

柱状图

饼状图

在这些例子中我们将用Python脚本来执行Mapplotlib命令。注意numpy和matplotlib模块需要通过import命令在脚本中进行导入。


np为nuupy模块的命名空间引用,plt为matplotlib.pyplot的命名空间引用:


import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

例1:离散和线性图

第一个脚本,script1.py 完成如下任务:


创建3个数据集(xData,yData1和yData2)

创建一个宽8英寸、高6英寸的图(赋值1)

设置图画的标题、x轴标签、y轴标签(字号均为14)

绘制第一个数据集:yData1为xData数据集的函数,用圆点标识的离散蓝线,标识为"y1 data"

绘制第二个数据集:yData2为xData数据集的函数,采用红实线,标识为"y2 data"

把图例放置在图的左上角

保存图片为PNG格式文件

script1.py的内容如下:


import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

 

xData = np.arange(0, 10, 1)

yData1 = xData.__pow__(2.0)

yData2 = np.arange(15, 61, 5)

plt.figure(num=1, figsize=(8, 6))

plt.title('Plot 1', size=14)

plt.xlabel('x-axis', size=14)

plt.ylabel('y-axis', size=14)

plt.plot(xData, yData1, color='b', linestyle='--', marker='o', label='y1 data')

plt.plot(xData, yData2, color='r', linestyle='-', label='y2 data')

plt.legend(loc='upper left')

plt.savefig('images/plot1.png', format='png')

所画之图如下:


5ba9fa4c0001058306400480.jpg


例2:柱状图

第二个脚本,script2.py 完成如下任务:


创建一个包含1000个随机样本的正态分布数据集。

创建一个宽8英寸、高6英寸的图(赋值1)

设置图的标题、x轴标签、y轴标签(字号均为14)

用samples这个数据集画一个40个柱状,边从-10到10的柱状图

添加文本,用TeX格式显示希腊字母mu和sigma(字号为16)

保存图片为PNG格式。

script2.py代码如下:


import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

 

mu = 0.0

sigma = 2.0

samples = np.random.normal(loc=mu, scale=sigma, size=1000)

plt.figure(num=1, figsize=(8, 6))

plt.title('Plot 2', size=14)

plt.xlabel('value', size=14)

plt.ylabel('counts', size=14)

plt.hist(samples, bins=40, range=(-10, 10))

plt.text(-9, 100, r'$\mu$ = 0.0, $\sigma$ = 2.0', size=16)

plt.savefig('images/plot2.png', format='png')

结果见如下链接:


5ba9fa4000011ac406400480.jpg


例3:饼状图

第三个脚本,script3.py 完成如下任务:


创建一个包含5个整数的列表

创建一个宽6英寸、高6英寸的图(赋值1)

添加一个长宽比为1的轴图

设置图的标题(字号为14)

用data列表画一个包含标签的饼状图

保存图为PNG格式

脚本script3.py的代码如下:


import numpy as np

import matplotlib.pyplot as plt

 

data = [33, 25, 20, 12, 10]

plt.figure(num=1, figsize=(6, 6))

plt.axes(aspect=1)

plt.title('Plot 3', size=14)

plt.pie(data, labels=('Group 1', 'Group 2', 'Group 3', 'Group 4', 'Group 5'))

plt.savefig('images/plot3.png', format='png')

结果如下链接所示:


5ba9fa310001277d06400480.jpg


总结

这个教程提供了几个用matplotlib科学画图包进行画图的例子,Matplotlib是在Linux环境中用于解决科学画图的绝佳方案,表现在其无缝地和Python、Numpy连接、自动化能力,和提供多种自定义的高质量的画图产品。matplotlib包的文档和例子详见这里。

编译自:http://xmodulo.com/matplotlib-scientific-plotting-linux.html作者: Joshua Reed
原创:LCTT https://linux.cn/article-4870-1.html译者: ideas4u

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