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quickGO:在线查询GO和GO注释信息的网站

标签:
Java

quickGO是EMBL-EBI发布的网站,通过该网站,可以快速的查询Go Terms和Go注释相关信息,官网如下

https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/

通过首页的搜索框,可以快速进行检索。

5c1f13d400012dde10800161.jpg

在搜索框中可以输入3种类型的信息

  1. GO number

  2. GO name

  3. gene product


检索时支持自动联想,可以根据输入数据自动匹配相关的GO和基因产物信息, 示意如下

5c1f13d40001bf1b08830559.jpg

对于Go Terms 而言,在检索结果中包含以下几种信息

1. Overview

展示每个GO Terms的编号,名字,详细的描述信息,所属分类等基本信息。

5c1f13d4000132fd10190263.jpg

2. Ancestor Chart

展示该Go Term到根节点的结构,示意如下

5c1f13d40001a30604650399.jpg

3. cross-references

展示该Go Terms与其他数据库的连接

5c1f13d400019fee10490181.jpg

除了以上信息外,还有更多其他种类的信息,可以到官网上详细查看。

对于GO annotations的信息,展示方式如下

5c1f13d40001d98b10800394.jpg

通过上方的下拉按钮,可以对数据进行筛选,添加了筛选条件的按钮会变成绿色。

筛选完成后,可以点击Customise筛选需要展示的列信息,然后点击Export导出结果。



作者:庐州月光
链接:https://www.jianshu.com/p/5bcc391089f0


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